人体肠道内的微生物群落对维持机体正常功能和健康至关重要，其生态学的改变目前已涉及到许多疾病的发病机制。因此，基于肠道微生物群落调节的新型治疗手段激起了广大研究者的兴趣。粪菌移植（fecal microbiota transplantation， FMT）通过移植健康人粪便中的功能菌群修复并重建受试者肠道菌群。迄今为止，FMT已经在难治性艰难梭菌感染、炎症性肠病、肠易激综合征、慢性功能性便秘、肠道肿瘤等疾病中展现出不凡的治疗效果，但因其作用机制和安全性未完全明确，该技术尚未被广泛应用。本文主要综述了粪菌移植技术的定义、作用机制、在胃肠道疾病中的作用及应用前景。