Phenome-centered multiomics study in pituitary tumors

Journal of Shandong First Medical Unversity & Shandong Academy of Medical Sciences››2022,Vol. 43››Issue (9): 641-665.DOI:10.3969/j.issn.2097-0005.2022.09.001

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Phenome-centered multiomics study in pituitary tumors

Peixian ZHENG¹(), Na LI¹^,²(), Xianquan ZHAN¹^,²()

^1.Medical Science and Technology Innovation Center，Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medicine Sciences，Jinan 250117，China
^2.Department of Radiation Oncology，Shandong Cancer Hospital & Institute，Jinan 250117，China

Received:2022-08-18Online:2022-09-25Published:2022-11-03
Contact:Xianquan ZHAN

以表型组为重心的垂体瘤多组学研究

郑培贤¹(), 李娜¹^,²(), 詹显全¹^,²()

^1.betway必威登陆网址医学科技创新中心，山东济南 250117
^2.betway必威登陆网址附属肿瘤医院放疗科，山东济南 250117

通讯作者:詹显全
作者简介:郑培贤，betway必威登陆网址 2019级临床医学国际班本科生，E-mail：1932647248@qq.com
李娜，博士，主要从事肿瘤放射治疗学工作，E-mail：qianshoulina@163.com。
詹显全，betway必威登陆网址教授，博士生导师，博士后合作导师，医学科技创新中心实验室主任，胃肠病研究所副所长，英国皇家医学院外籍院士，济南市 A 类高层次人才，山东省惠才卡审核颁发类高层次人才。华西医科大学本硕博毕业后，到湘雅医学院从事博士后工作，后赴美国克利夫兰临床中心和田纳西大学留学 11 年，期间被聘为田纳西大学副教授。2012 年以海外优秀人才引进为中南大学教授、博士生导师和博士后合作导师，湖南省百人计划专家、湖南省高层次卫生人才“225”工程医学学科带头人，中南大学“531”人才工程专家；协同创立中国抗癌药物国家地方联合工程实验室并担任技术委员会委员、技术带头人和副主任，协同创立教育部批准的“临床蛋白质组学与结构生物学”二级学科并担任学术带头人和学科负责人，协同成功申报获得国家临床重点专科建设项目/重点实验室项目并担任学科带头人，获得湖南省国际科学技术合作奖和“潇湘友谊”奖。欧洲科技合作组织（e-COST）海外评审专家、英国科学基金委海外评审专家。目前正致力于从多参数系统策略角度阐述肿瘤的分子机理、发现肿瘤分子标志物，研究并整合基因组、转录组、蛋白质组和代谢组的变异来实现肿瘤的预测、预防与个体化治疗及精准医学。已发表学术论文150余篇，主编国际学术专著6本，参编国际学术专著 28 本，获得美国发明专利2个。受邀担任105种国际期刊的主编、副主编、编委及102种国际SCI期刊的论文审稿专家。受邀在Mass Spectrometry Reviews（IF 10.946）、Frontiers in Endocrinology（IF 6.055）、EPMA Journal（IF 8.836），Oxidative Medicine Cellular Longevity（IF 7.310）和Frontiers in Oncology（IF 6.243）等国际期刊上客座主编了15个学术专刊。
基金资助:
betway必威登陆网址人才引进基金（詹显全）;山东省自然科学基金(ZR2021MH156);湖南省百人计划专项（詹显全）;国家自然科学基金(81572278);国家高技术研究发展计划（863）项目(2014AA020610-1)

Abstract

Abstract:

Pituitary tumor is a common， chronic， complex intracranial tumor， which in fact is a whole-body disease with multi-causing factors， multi-processes， multi-consequences， and highly heterogeneous characteristics. It is involved in a series of changes in molecules at the different levels of genome， transcriptome， proteome， peptidome， metabolome， and radiome in pituitary tumorigenesis， and these molecules are mutually associated in a molecular-network system. It is necessary to use muti-parameter systematic strategy but not the traditional single-factor strategy to elucidate the molecular mechanisms and manage pituitary tumors. Multiomics and systems biology is promoting this paradigm shift. However， the center of multiomics is moving from structural genomics to phenomics （proteomics and metabolomics）. Of them， mass spectrometry-based proteomics and proteoformics studies take crucial part in the multiomics strategy of pituitary tumors. This review paper summarizes the current status of multiomics， multiomics-based molecular pathway networks， pattern biomarkers， and therapeutic targets/drugs， and future perspectives for predictive， preventive and personalized medicine （PPPM； 3PM） in pituitary tumors.

Key words:biomarker,molecular network,multiomics,phenome,pituitary tumor,proteomics

摘要：

垂体瘤是常见的、慢性的、复杂性的颅内肿瘤，是一种多病因、多过程、多后果的全身性疾病。传统的单因素模型很难阐明垂体瘤的分子机制，而随着多组学和系统生物学的迅速发展，传统的单因素策略逐渐转变为多因素系统策略，更有利于垂体瘤的预测、预防和治疗。在垂体瘤的发生发展过程中，基因组、转录组、蛋白质组、肽组、代谢组和影像组等水平的一系列分子改变均发挥了重要作用，并相互关联形成了复杂的分子网络系统。此外，多组学的重心正从结构基因组学转向表型组学（蛋白质组学和代谢组学）。在垂体瘤的多组学系统策略中，基于质谱分析的蛋白质组学和蛋白质存在形式的研究（proteoformics）起着核心作用。本文综述了多组学、基于多组学的分子通路网络、基于分子通路网络的生物标志物和治疗靶点的研究现状，并对垂体瘤的预测、预防和个体化医学（predictive， preventive and personalized medicine， PPPM）进行了展望。

关键词:生物标志物,分子网络,多组学,表型组学,垂体腺瘤,蛋白质组学

Peixian ZHENG, Na LI, Xianquan ZHAN. Phenome-centered multiomics study in pituitary tumors[J]. Journal of Shandong First Medical Unversity & Shandong Academy of Medical Sciences, 2022, 43(9): 641-665.

郑培贤, 李娜, 詹显全. 以表型组为重心的垂体瘤多组学研究[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2022, 43(9): 641-665.

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