二代测序技术在胸腔积液病因诊断中的应用进展

摘要/Abstract

摘要：

胸腔积液作为一种常见的临床表现，其病因复杂多样，传统检验方法已满足不了目前临床诊断的需求。二代测序（next-generation sequencing，NGS）技术是一项正在飞速发展的新兴技术，对比传统检验方法有诸多优势。本文对近年来二代测序技术在胸腔积液病因诊断中的应用进展以及胸腔积液作为样本的可行性方面作一综述。

滕佳凝, 魏丽. 二代测序技术在胸腔积液病因诊断中的应用进展[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2023, 44(1): 59-62.

Jianing TENG, Li WEI. Progress of next-generation sequencing in the etiology diagnosis of pleural effusion[J]. Journal of Shandong First Medical Unversity & Shandong Academy of Medical Sciences, 2023, 44(1): 59-62.

参考文献45

1	Jany B， Welte T. Pleural effusion in adults-etiology， diagnosis， and treatment［J］. Dtsch Arztebl Int， 2019， 116（21）： 377.
2	Hooper C， Lee YC， Maskell N. Investigation of a unilateral pleural effusion in adults： British Thoracic Society pleural disease guideline 2010［J］. Thorax， 2010，65 ：ii4.
3	Karkhanis VS， Joshi JM. Pleural effusion： diagnosis， treatment， and management［J］. Open Access Emerg Med， 2012， 4： 31.
4	雷震，王震，郭锋. 外周血NLR、PLR及胸水ADA、LDH在鉴别胸腔积液性质中的应用［J］. 分子诊断与治疗杂志， 2021， 13（7）： 1102.
5	陈小蓉，曾惠清，王洺辉，等. 生物学标志物在渗出性胸腔积液诊断的研究进展［J］. 中国呼吸与危重监护杂志， 2021， 20（2）： 148.
6	佟威威，佟广辉，王婧，等. Cyfra21-1、NSE、SCCA和CRP在肺癌诊断中的应用［J］. 中国免疫学杂志， 2015， 31（3）： 396.
7	于瑞珍，于国厚，徐传胜. 胸腔积液脱落细胞与肿瘤标志物联合检查的临床价值［J］. 国际检验医学杂志， 2015， 36（16）： 2414.
8	Sundaralingam A， Banka R， Rahman NM. Management of pleural infection［J］. Pulm Ther， 2021， 7（1）： 59.
9	薛立福. 恶性胸腔积液检测方法及评价［J］. 中华结核和呼吸杂志， 2001， 24（1）： 18.
10	He Y， Zhang W， Huang T， et al. Evaluation of a diagnostic flow chart applying medical thoracoscopy， adenosine deaminase and T-SPOT.TB in diagnosis of tuberculous pleural effusion［J］. Eur Rev Med Pharmacol Sci， 2015， 19（19）： 3563.
11	张芸，姜广路，王冲，等. 经内科胸腔镜胸膜病变活检对结核性胸膜炎的诊断价值［J］. 中国防痨杂志， 2020， 42（11）： 1158.
12	Zhang T， Wan B， Wang L， et al. The diagnostic yield of closed needle pleural biopsy in exudative pleural effusion： a retrospective 10-year study［J］. Ann Transl Med， 2020， 8（7）： 491.
13	隋雨，谷月，温中梅，等. 内科胸腔镜对老年不明原因胸腔积液患者的诊断价值［J］. 中国老年学杂志， 2017， 37（22）： 5649.
14	黄华萍，李羲. 胸腔积液患者不能进行内科胸腔镜检查的原因分析与思考［J］. 中华肺部疾病杂志（电子版）， 2015， 8（2）： 70.
15	Behjati S， Tarpey PS. What is next generation sequencing？［J］. Arch Dis Child Educ Pract Ed， 2013， 98（6）： 236.
16	Miao Q， Ma Y， Wang Q， et al. Microbiological diagnostic performance of metagenomic next-generation sequencing when applied to clinical practice［J］. Clin Infect Dis， 2018， 67（）： S231.
17	Miao Q， Ma Y， Wang Q， et al. Microbiological diagnostic performance of metagenomic next-generation sequencing when applied to clinical practice［J］. Clin Infect Dis， 2018， 67（）： S231.
18	Sabour L， Sabour M， Ghorbian S. Clinical applications of next-generation sequencing in cancer diagnosis［J］. Pathol Oncol Res， 2017， 23（2）： 225.
19	Aravanis AM， Lee M， Klausner RD. Next-generation sequencing of circulating tumor DNA for early cancer detection［J］. Cell， 2017， 168（4）： 571.
20	陈思名，雷雨，白俊. 罕见基因突变晚期非小细胞肺腺癌靶向治疗有效1例［J］. 现代肿瘤医学， 2021， 29（24）： 4403.
21	Bharadwaj R， Raman T， Thangadorai R， et al. Targeted next generation sequencing （NGS） to diagnose hereditary hemolytic anemias［J］. Int J Hematol Oncol Stem Cell Res， 2020， 14（3）： 177.
22	Gu W， Miller S， Chiu CY. Clinical metagenomic next-generation sequencing for pathogen detection［J］. Annu Rev Pathol， 2019， 14： 319.
23	Padmanabhan R， Mishra AK， Raoult D， et al. Genomics and metagenomics in medical microbiology［J］. J Microbiol Methods， 2013， 95（3）： 415.
24	Goldberg B， Sichtig H， Geyer C， et al. Making the leap from research laboratory to clinic： challenges and opportunities for next-generation sequencing in infectious disease diagnostics［J］. mBio， 2015， 6（6）： e01888.
25	Dekker JP. Metagenomics for clinical infectious disease diagnostics steps closer to reality［J］. J Clin Microbiol， 2018， 56（9）： e00850.
26	Chiu CY， Miller SA. Clinical metagenomics［J］. Nat Rev Genet， 2019， 20（6）： 341.
27	Zhang Q， Li S， Zhou W， et al. Application of metagenomic next-generation sequencing （mNGS） combined with rapid on-site cytological evaluation （ROSCE） for the diagnosis of Chlamydia psittaci pneumonia［J］. Int J Clin Exp Pathol， 2021， 14（4）： 389.
28	Xie G， Zhao B， Wang X， et al. Exploring the clinical utility of metagenomic next-generation sequencing in the diagnosis of pulmonary infection［J］. Infect Dis Ther， 2021， 10（3）： 1419.
29	Wang J， Han Y， Feng J. Metagenomic next-generation sequencing for mixed pulmonary infection diagnosis［J］. BMC Pulm Med， 2019， 19（1）： 252.
30	Xu A， Zhu H， Gao B， et al. Diagnosis of severe community-acquired pneumonia caused byAcinetobacter baumanniithrough next-generation sequencing： a case report［J］. BMC Infect Dis， 2020， 20（1）： 45.
31	Wu S， Hu W， Xiao W， et al. Metagenomic next-generation sequencing assists in the diagnosis ofGardnerella vaginalisin males with pleural effusion and lung infection： a case report and literature review［J］. Infect Drug Resist， 2021， 14： 5253.
32	Xia J， Xia L， Zhou H， et al. Empyema caused byStreptococcusconstellatus： a case report and literature review［J］. BMC Infect Dis， 2021， 21（1）： 1267.
33	Simner PJ， Miller S， Carroll KC. Understanding the promises and hurdles of metagenomic next-generation sequencing as a diagnostic tool for infectious diseases［J］. Clin Infect Dis， 2018， 66（5）： 778.
34	《中华传染病杂志》编辑委员会. 中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识［J］. 中华传染病杂志， 2020， 38（11）： 681.
35	魏树全，钟维农，谭锦文，等. 支气管镜检查在疑诊肺结核痰菌阴性患者中的诊断价值［J］. 中国感染与化疗杂志， 2018， 18（1）： 6.
36	Wu H， Wei J， Yu D. Application of NGS in diagnosis of tuberculous pleurisy with multiple negative tests： a case report［J］. Infect Drug Resist， 2020， 13： 3543.
37	张杏怡，周新，何礼贤，等. 经纤维支气管镜采样技术在肺部感染病原学诊断中的应用［J］. 中国抗感染化疗杂志， 2003， 3（5）： 273.
38	高春，高丽华，赵军，等. 不同纤维支气管镜肺泡灌洗液量对重症肺炎的疗效和病原学检测结果的影响［J］. 临床内科杂志， 2021， 38（7）： 489.
39	胡忠. 纤维支气管镜在重症肺炎中的应用研究进展［J］. 临床荟萃， 2014， 29（2）： 230.
40	Yi H， Fang J， Huang J， et al. Legionella pneumophila as cause of severe community-acquired pneumonia， China［J］. Emerg Infect Dis， 2020， 26（1）： 160.
41	Guo F， Kang L， Xu M. The application value of metagenomic next-generation sequencing in children with invasive pneumococcal disease［J］. Transl Pediatr， 2021， 10（12）： 3282.
42	Kanellakis NI， Wrightson JM， Gerry S， et al. The bacteriology of pleural infection （TORPIDS）： an exploratory metagenomics analysis through next generation sequencing［J］. Lancet Microbe， 2022， 3（4）： e294.
43	李雪莲，陈红梅，张立群，等. 三种胸腔积液检测方法对结核性胸膜炎诊断价值的研究［J］. 中国医刊， 2018， 53（2）： 134.
44	彭燕琼，李秀娟，杜荣. 老年肺癌患者化疗期间并发医院感染的危险因素及病原菌分布和药敏实验［J］. 中国老年学杂志， 2019， 39（13）： 3130.
45	崔沐，张夕凉. 老年肺癌患者院内感染相关因素及其干预措施分析［J］. 中国病原生物学杂志， 2018， 13（9）： 1024.

[1]	郭青, 任玥, 郭加专, 蒋胜华.IgG4相关胸膜疾病的研究进展[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2023, 44(6): 477-480.
[2]	张苏雅, 吕镔.超声影像融合技术对肝占位的诊断价值[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2023, 44(4): 313-316.
[3]	张琼, 黄雯, 葛亚龙, 梁英.2例胰岛素瘤诊治分析[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2023, 44(2): 138-141.
[4]	李晔, 曾庆师, 黄正, 牟海萍, 姜虎, 于博睿, 杨龙霆.不同影像学技术在肛瘘诊断应用中的Meta分析[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2023, 44(1): 42-48.
[5]	许璇, 仇玮, 丁瑾.子宫体原发性弥漫大B细胞淋巴瘤临床病理观察[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2022, 43(8): 596-600.
[6]	赵红金, 刘辉, 黄辉, 郑修竹, 徐惠, 辛越.梨状肌综合征的影像诊断进展[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2022, 43(6): 462-465.
[7]	许邦礼, 赵青赞, 陈蒙蒙, 高超.血清SCGN联合aEEG在新生儿缺氧缺血性脑病早期诊断和近期结局评估的价值[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2022, 43(6): 422-426.
[8]	王求知, 靳尧, 潘家超, 张淑红.肝癌血清标志物预测模型的建立及诊断价值评估[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2022, 43(6): 401-407.
[9]	房忠卫, 周宪伟, 曹志强, 宋艳芳, 任更朴.外周血NLR、PLR、SII在甲状腺结节中的诊断价值[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(9): 675-679.
[10]	张灿勇, 冯璋, 臧成瑜, 王一兵.特重烧伤患者的血小板和血钙数值变化及其对预后的预测作用[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(6): 420-422.
[11]	朱东红.CT引导下钻孔引流术治疗外伤性亚急性硬膜下血肿的效果分析[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(4): 315-316.
[12]	付立武, 尤斌.PET联合CT在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的诊断价值及特征研究[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(4): 305-307.
[13]	马清悦, 孟超, 胡磊.多重实时荧光定量聚合酶链反应在急性视网膜坏死诊疗中的应用[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(3): 238-240.
[14]	杨斌, 张东宁, 孙象军.儿童纤维板层型肝细胞癌1例及文献复习[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(3): 232-233.
[15]	张丽.组织学病理学和分子分类对乳腺癌的病理诊断价值[J]. betway必威登陆网址（betway.com ）学报, 2021, 42(2): 153-154.

二代测序技术在胸腔积液病因诊断中的应用进展

Progress of next-generation sequencing in the etiology diagnosis of pleural effusion

RichHTML

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献45

相关文章15

编辑推荐

Metrics